本刊有一篇论文入选2012年度“中国百篇最具影响优秀国内学术论文”。 题目：中国部分市县前列腺癌发病趋势比较研究；论文作者：李鸣；所属机构：北京肿瘤医院；来源期刊：中华泌尿外科杂志，2009，30（06）：368-370；被引次数：36次。

       2012年中华医学会系列杂志中有10篇论文被评为“中国百篇最具影响优秀国内学术论文”。

       “中国百篇最具影响优秀国内学术论文”的选取范围是从2013年度“领跑者5000---中国精品科技期刊顶尖论文”中进一步遴选产生的。2013年度F5000论文是以2008—2012年中国科技论文与引文数据库（CSTPCD）为基础，统计全部论文的累计被引用次数，并分别遴选出发表在中国精品科技期刊上，且累计被引用次数进入相应发表年度和所属学科领域的前百分之一的论文，则入选为F5000论文。百篇论文的选取实在F5000论文的基础上，进一步提高了遴选标注，从中选取累计被引用次数进入相应发表年度和所属学科领域的前千分之一的论文，作为本年度的候选论文。根据各学科领域的论文数量和规模以及候选论文数量，结合我国科技发展的重点领域和优先主题，参考候选论文的文献类型、基金项目资助情况、被引用分布等方面的情况，从中择优选取“中国百篇最具影响优秀国内学术论文”。2012年度共选出91篇论文作为“中国百篇最具影响优秀国内学术论文”。